好文收藏:前沿空间组学技术系统比对

发布网友 发布时间：2024-10-24 11:11

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热心网友 时间：2024-11-01 18:59

空间组学技术揭示组织内细胞组织和相互作用的深入奥秘，其原位分析能够识别具有差异RNA或蛋白丰度的特定区域，并描绘它们的互作关系。此技术尤其在肿瘤免疫微环境中展现出强大的解析能力。然而，这些技术在空间分辨率、检测通量和覆盖范围方面存在差异，适用于不同研究需求。

空间转录组技术分为两大类型：固相转录组捕获技术和确定性空间条形码技术。前者已经发展至亚细胞分辨率，例如Stereo-seq技术，但最广泛应用的商品化技术是10X公司的Visium平台，能检测大约5000个直径55μm的spot，每个spot可能含有1-10细胞。Visium通过预先设计的索引探针捕获样本中的RNA进行后续测序，为组织切片提供网格非连续的整片数据。后者通过灵活的组织区域分析，需要病理学家预先确定ROI，通过空间转录组解析细胞群体的基因表达情况。例如，NanoString公司的GeoMX DSP平台可以对直径50-600μm的ROI进行靶向检测大约18000个基因。

空间单细胞蛋白组技术主要分为基于质谱和循环荧光染色两大类。前者通过带有稀有金属标签的抗体进行检测，如成像质谱流式（IMC）和多重离子束成像（MIBI），它们可以在特定区域进行激光消融或初级离子束轰击，实现高分辨率的蛋白质检测。后者利用寡核苷酸标签标记抗体，一次性加入所有抗体，通过洗脱探针避免反复剥离带来的损害。最具代表性的技术是Akoya公司的PhenoCycler空间单细胞蛋白组平台，其优势在于实现整片扫描，最大成像面积可达18mm x 35mm，单细胞分辨率可达250nm。

空间组学技术的不断发展，使得生物医学研究进入空间组学时代。华盈生物紧跟科学前沿，打造了PhenoCycler多重荧光染色和IMC成像质谱流式技术体系，为科学家提供了从蛋白质层面深入探索组织形态和细胞亚群的新工具。华盈生物作为专业的蛋白组学技术服务公司，拥有多项特色服务，业务覆盖多个领域，为科学研究提供强大支持。华盈生物凭借其专业性和专注度，获得国内众多高校和院士课题组的广泛认可，科研成果发表在国际知名期刊上。